纽约市立大学史坦顿岛学院教授
纽约市立大学史泰登岛学院副教授
纽约市立大学史泰登岛学院助理教授
美国马里兰州贝塞斯达国立卫生研究院客座研究员
沈昌輝 教授
紐約市立大學史坦頓分校生物學系主任
紐約市立大學生物學博士班 教授
紐約市立大學生物化學博士班 教授
度
国立中兴大学理学士
国立中兴大学硕士
博士,爱丁堡大学(苏格兰)
(*:天博体育;**:研究生)
执法的文章
陈晓明,陈晓明,陈晓明,陈晓明。(2017)Hxk2p基因表达对细胞程序性死亡的影响。生物化学学报,2004,23(3):393 - 398。
谢丽娟**,李娥**,沈超。(2017)Pah1p基因对V-ATPase基因表达和液泡酸化的影响。生物化学与工程学报,2004,22(3):693- 693。
Isma Butt*, Andrew Hong*, Di Jing, Sonia Aracena**, Probal Banerjee,沈昌辉。(2014) 5 -羟色胺1a受体对雌性小鼠体重和食物摄入量的影响与下丘脑神经肽和GABAA受体的差异表达有关。神经肽,48,313-318。
Roshini N Wimalarathna**, Pan Po Yun *,沈长辉(2014)酵母菌CUP1激活需要Ino80p和Snf2p的共依赖募集。物化学。细胞生物学,92,69-75。
Abdeslem El Idrissi, Chang Hui Shen和William J. L 'Amoreaux。(2013)牛磺酸在衰老过程中的神经保护作用。氨基酸,45,735-750。
Andrew Hong*,张爱英**,柯杨,Abdeslem El Idrissi,沈昌辉(2012)GABAA b亚基在脆性X智力发育迟滞蛋白缺失小鼠大脑中的表达减少。神经科学杂志。46,272-275。
Roshini N. Wimalarathna**, Po Yun Pan* and Chang-Hui Shen(2012)酵母菌CUP1的染色质重定位活性和转录机制均由Ace1p募集。生物工程学报,2016,33(2):658-663。
Paulina Konarzewska**, Michelle Esposito**和Chang-Hui Shen (2012) INO1诱导需要染色质重塑酶Ino80p和Snf2p,而不需要组蛋白乙酰化酶。中国生物医学工程学报,2016,33(2):488 -488。
Roshini N. Wimalarathna**,蔡辰汉*,沈昌辉(2011)酵母磷脂生物合成相关基因的转录调控。[J] .微生物学通报,2009,31(4):444 - 444。
Michelle Esposito**, Paulina Konarzewska**, Oluwafemi Odeyale*,沈长辉(2010)酵母INO1启动子中组蛋白乙酰化的激活子依赖性募集。生物化学学报,39(1),1285-1290。
张爱英**,沈昌辉,马双勇,柯杨,Abdeslem El Idrissi(2009)脆性X小鼠模型中自闭症相关基因的表达改变。中国生物医学工程学报,32(2):444 - 444。
沈昌辉*,王晓明,王晓明(2008)活化因子对激活因子的影响。生物化学学报,36(3):662 - 662。
Jason Ford*, Oluwafemi Odeyale*, Antonious Eskandar*, Nafila Kouba*,沈长辉(2007)INO1启动子中SWI/SNF-和ino80依赖的核小体运动。生物化学学报,36(1),974-979。
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Peter R. Eriksson, Geetu Mendiratta, Neil McLaughlin, Tyra Wolfsberg, Leopoldo Maríño-Ramirez, Tiffany Pompa*, Mohendra Jainerin*, David Landsman, Chang-Hui Shen和David J. Clark(2005)酵母SPT10基因编码的组蛋白乙酰转移酶特异性结合在主要核心组蛋白启动子Mol. Cell的上游激活序列上。生物学报,25,9127-9137。
金燕贞,沈昌辉,David Clark.(2004)酵母质粒染色质的纯化和核小体定位分析。方法。33,59-67。
沈昌辉,Benoit P. Leblanc, Carolyn Neal, Ramin Akhaven, David J. Clark。(2002)酵母CUP 1启动子的靶向组蛋白乙酰化需要转录激活子、TATA盒和假定的由SPT10编码的组蛋白乙酰化酶。摩尔。细胞。生物学报22,6406-6416。
沈昌辉,伯努瓦·勒布朗,詹妮弗·阿尔菲利和大卫·克拉克。(2001)酵母CUP 1染色质的重塑涉及整个基因和侧翼序列上核小体的激活剂依赖性重新定位。摩尔。细胞。《圣经》21:53 -547。
Chang-Hui Shen和David Clark, (2001) DNA序列在确定酵母染色质中的核小体位置中起主要作用。生物。化学276:35209 - 3516。
书
沈昌辉(2012)组蛋白:类、结构与功能,新科学出版社纽约。ISBN-13: 978-1-62100-274-1。
本章
沈昌辉,Eugene Lempert*, Isma Butt*, Lorenz S. Neuwirth**, Yan Xin **, Abdeslem El Idrissi(2013)牛磺酸对抑制突触基因表达的影响。参见:Abdeslem El Idrissi和William L 'Amoreaux,牛磺酸8:生理和作用机制,pp . 187-194, bb2010,纽约。isbn - 978 - 1 - 4614 - 6129 - 6。
沈昌辉(2012)连接子组蛋白与染色质结构。作者:沈昌辉。组蛋白:类,结构和功能,pp . 35-57,新星科学出版社,Inc。纽约。ISBN-13: 978-1-62100-274-1。
Roshini Wimalarathna**,沈昌辉(2012)组蛋白修饰与基因表达。作者:沈昌辉。组蛋白:类,结构和功能,第89-108页,新星科学出版社,Inc。纽约。ISBN-13: 978-1-62100-274-1。
会议摘要
Jaclyn DiBello*, Fina Vitale*,沈昌辉。用酵母INO80蛋白截断突变体鉴定组蛋白乙酰化赖氨酸残基CSI大学生大会,纽约,2017。
Christine Huynh*, Dilakshi Mampitiya*, Alicia Seecoomar*, Kristina Lam*。利用同源重组技术改造酵母HAT/HDAC突变株。CSI大学生大会,纽约,2015。
Dhiwya Alex*, Goldie Sherr**,沈昌辉。构建PAH1-HA和OPI1-GFP标记酵母菌,以确定Pah1p和Opi1p在调节UASINO基因表达中的相互作用。CSI大学生大会,纽约,2015。
沈昌辉和米歇尔·埃斯波西托。酵母INO1基因表达的表观遗传调控工作模型。自然会议:了解疾病的基因组技术和生物材料。圣地亚哥,加州,2014年。
Christine Huynh*, Dilakshi Mampitiya*, Suzanne Ahmed*, Jwala Alex*, Kristi Russo*。酵母染色质重塑和组蛋白乙酰化酶/去乙酰化酶敲除菌株的构建与筛选CSI大学生大会,纽约,2014。
Dhiwya Alex*, Christine Samuel*, Ekrem Yetiskul*, Goldie Sherr*,沈昌辉。PAH1基因编码的酿酒酵母磷脂酸磷酸酶的调控CSI大学生大会,纽约,2014。
沈昌辉,Michelle Esposito, Paulina Konarzewska。酵母INO1激活的工作模型,其中染色质重塑子的解离可能是由乙酰化引起的。EMBO会议:细胞信号传导和调控中的变构相互作用。巴斯德研究所,巴黎,法国,2013。
Alina Kogan, Wafa Shakil, Valerie Imaduerie, Aun Syed, Michelle Esposito和沈昌辉。构建Ino80-FLAG Gcn5p敲除酵母菌,鉴定组蛋白乙酰化酶在INO1转录激活中的新作用。CSI大学生大会,纽约,2013。
Amara Abid, Merlin Raj, Goldie Lazarus,沈昌辉。Pah1p在磷脂生物合成途径表达中的作用。CSI大学生大会,纽约,2013。
Isma Butt*和沈昌辉。5-HT1A受体对摄食行为及下丘脑神经肽表达的影响。CSI大学生大会,纽约,2012。
Eugene Lempert*和沈昌辉。负责招募染色质重塑活动的Ino2p关键结构域的克隆。CSI大学生大会,纽约,2011。
Roshini Wimalarathna**,潘宝云*,沈昌辉。(2011)酵母CUP1基因的转录调控。物化学。细胞生物。(抽象)
Eugene Lempert*和沈昌辉。(2011)克隆负责招募染色质重塑活动的Ino2p关键结构域。CSI大学生大会,纽约,2011。
Roshini Wimalarathna**,潘宝云*,沈昌辉。酵母CUP1基因的转录调控。第32届国际会议- Asilomar染色质和染色体会议。CA, 2010年。
Michelle Esposito*, Paulina Konarzewska**和沈昌辉。INO1启动子的组蛋白乙酰化需要转录激活子和Gcn5p和Esa1p组蛋白乙酰化酶。CSI天博体育会议,纽约,2009。
杰森·福特*和沈昌辉。SWI/SNF和INO80有助于INO1启动子的局部核小体动员。CSI大学生会议,纽约,2008。
沈昌辉,Jason Ford*和Oluwafemi Odeyale*。romatin重塑活动在INO1激活中的作用。生物复杂性研讨会:转录疾病。索尔克研究所,圣地亚哥,加州,2007。
Tiffany Pompa*, Jonathan Blaize*, William L 'Amoreaux和沈昌辉。环境因素对细胞内甲基化和乙酰化的影响。显微与微量分析2006年会议。芝加哥。
Tiffany Pompa*, Jonathan Blaize*, William L 'Amoreaux和沈昌辉。假定的组蛋白乙酰化酶Spt10p和化学修饰组蛋白H3的共定位。显微与微量分析2005年会议。夏威夷火奴鲁鲁。
Oluwafemi Odeyale*和沈昌辉。组蛋白修饰酶与染色质重塑复合体在INO1活化中的相互作用。纽约市
路易斯中风联盟少数民族参与会议,史蒂文理工学院在新泽西州,2005年。
Oluwafemi Odeyale*和沈昌辉。染色质重塑复合体在酵母INO1基因表达中的作用。2005年全国会议与研究研讨会,石溪,获生物科学海报第一名。
Oluwafemi Odeyale*和沈昌辉。染色质重塑复合体在酵母INO1基因表达中的作用。少数民族学生年度生物医学研究会议,达拉斯,德克萨斯州,2004年,页280。
Oluwafemi Odeyale*和沈昌辉。染色质重塑复合体在酵母INO1基因表达中的作用。纽约市路易斯中风联盟少数民族参与会议,布鲁克海文国家实验室,2004年。
Antonious Eskandar*, Nafila Kouba*, Oluwafemi Odeyale*, Baishali Kanjilal+,沈昌辉。酵母Ino80p的体内染色质重塑。第69届冷泉港定量生物学研讨会。纽约冷泉港2004年,第58。
沈昌辉和大卫·克拉克。CUPI启动子上的组蛋白超乙酰化需要转录激活子和TATA盒。《真核生物转录调控机制》,2001,第90页。
沈昌辉,伯努瓦·勒布朗,詹妮弗·阿尔菲利和大卫·克拉克。从酵母细胞中纯化的转录活性金属硫蛋白基因的染色质结构,基石专题讨论会-染色质结构和功能。杜兰戈,科罗拉多州,2000,页72。
分子生物学实验室-研究
我们实验室正在进行的研究继续专注于了解基因表达的机制,重点是转录共激活因子在基因激活中的作用。我们重点研究脂质代谢变化或重金属代谢的调控所引发的代谢信号及其与细胞内主要细胞信号转导通路和转录网络的相互作用。沈博士实验室的其他项目包括自闭症相关基因的转录调控,神经素敲除动物模型和自闭症障碍,血清素5-HT1A受体对摄食行为的影响。
我们最近的工作之一集中在INO1表达的机制上。在缺乏肌醇的情况下,INO1的表达被诱导。研究表明,Gcn5p和Esa1p分别通过在INO1启动子处乙酰化组蛋白H3和H4参与了这种诱导。Gcn5p-SAGA复合体募集到该区域是对组蛋白H3 Ser10磷酸化的反应。这种组蛋白修饰是由Snf1激酶催化的,它被Ino2p募集。组蛋白乙酰化酶的募集不依赖于染色质重塑物的存在。染色质重塑子为INO1激活提供了一种不同的途径。一些证据表明,Snf2p和Ino80p都是INO1激活所必需的。我们最近的研究表明,Snf2p和Ino80p通过创造一个更容易接近的核体DNA来积极调节INO1的表达,并且都是INO1染色质重构和基因激活所必需的。我们还发现,Ino2p激活剂对于招募Ino80p和Snf2p至关重要。此外,它们以顺序的方式被招募到INO1启动子,而INO80需要招募SWI/SNF。诱导后两种重塑蛋白都离开启动子。
虽然对重塑者的募集进行了一定程度的研究,但无论是组蛋白乙酰化酶和去乙酰化酶在INO1诱导中的功能作用,还是染色质重塑者的募集和解离机制都尚不清楚。最近的研究表明,一旦转录开始,染色质重塑子就会离开启动子区域,而离开的作用可能是由重塑子乙酰化引起的。同时,重塑蛋白在被招募到启动子之前可能需要去乙酰化。根据这些最近的发现和我们的工作,我们提出了一个模型来描述在基因激活过程中共激活因子如何作用于INO1染色质。在抑制条件下,Opi1p、Ino2p/Ino4p和Ume6p-Sin3p-Rpd3p复合物存在于启动子上。启动子核小体的组蛋白尾部被Ume6p-Sin3p- Rpd3p复合物(一种辅助抑制因子-去乙酰化酶复合物)去乙酰化。同时,依赖激活子的Ino80p和Snf2p以乙酰化形式被招募到启动子中。虽然转录激活子和染色质重塑子在抑制条件下存在于启动子中,但转录激活子在Opi1p存在时是静止的。这是因为Opi1p通过其激活子相互作用域与Ino2p的抑制子相互作用域的结合来介导抑制。重塑子保持无活性,染色质处于静止状态。
在诱导条件下,Ino80p和Snf2p都被Rpd3p去乙酰化,然后Ume6p-Sin3p-Rpd3p复合物和Opi1p从启动子中分离出来。随后,Ino2p/Ino4p激活子开始发挥功能,Snf1p、Gcn5p和Esa1p通过Ino2p被招募到启动子上。组蛋白尾部乙酰化。同时,功能的Ino2p/Ino4p刺激SWI/SNF和INO80的活性,导致启动子核小体的靶向运动。因此,染色质重塑发生在启动子区域。一旦运动开始,Ino80p和Snf2p就不再需要了。更多的Gcn5p被招募,因此两种重塑子都可以乙酰化以脱离INO1启动子。动态核小体通量允许RNA聚合酶II进入其结合位点并启动转录。当系统恢复到抑制状态时,剩余的SWI/SNF可能负责将启动子核小体移回其原始位置。因此,该模型证明了乙酰化酶和去乙酰化酶在激活过程中的功能作用,并解决了诱导后重塑酶如何与启动子分离的问题。然而,关于乙酰化酶/去乙酰化酶与重塑酶之间的联系,以及重塑酶的乙酰化对基因激活的影响等细节仍有待确定。因此,我们目前的研究旨在通过两个具体目标来了解转录激活的机制:(1)研究Ino80p乙酰化的机制,并确定哪些氨基酸残基负责Ino80p乙酰化;(2)探讨Ino80p乙酰化在INO1诱导中的功能作用。这些研究将提供染色质重塑酶和组蛋白修饰酶之间的功能意义和联系,并为基因表达机制提供新的见解。
教学
2012年春季
遗传学实验室(BIO 312)诊断分子生物学(BIO 325)癌症生物技术(CUNY研究生中心)
2013年冬季
生物460
2013年春季
诊断分子生物学(BIO 325)微生物学和细胞病理学(BIO 350)免疫学(BIO 442)
2013年夏季
分子生物学和生物技术实验室(BIO 424)
2013年秋季
诊断分子生物学(bio325)
2014年冬季
生物460
2014年春季
诊断分子生物学(BIO 325)遗传学实验室(BIO 312)
2013年夏季
分子生物学和生物技术实验室(bio424)
2013年秋季
诊断分子生物学(bio325)生物技术入门(bio706)
实验室成员
沈昌辉博士Changhui.shen@csi.cuny.edu
现实验室成员
研究生
- 乔治Kaluski
- Jamilia Mambetalieva
本科
- 迈克尔Adejokun
- 玛丽亚Chaudhri
- 戴安娜Laterman
- 妮可dushkin
- 丹尼尔Krichavets
前实验室成员
- Roshini Wimalarathna博士
- 米歇尔·埃斯波西托博士
- Paulina Konarzewska博士
- 戈尔迪·拉扎勒斯博士
- 克里斯汀黄齐
- Dhiwya亚历克斯
- 克里斯汀·塞缪尔
- Dilakshi Mampitiya
- 苏珊娜·艾哈迈德
- 安德鲁在香港
- 迈克蔡
- 海伦Vlagas
- 汤姆唐
- 克丽丝蒂Russo
- Jwala亚历克斯
- 格雷西蔡
- Alina Kogan
- 菲利普·马
- 阿玛拉阿比德
- 莱西玛·Varghese
- 瓦法Shakil
- 梅林拉吉
- Senada Lekperic
- Aun Syed
- 瓦莱丽Imaduerie
- 尤金的总裁
- 互联网统计对接
- 布丽姬特Glazarov
- Mjellma Blakaj
- 蒂芙尼Pompa
- 凡妮莎Cantasano
- 安东尼·埃斯坎达
- Mohendra Jainerin
- Nafila Kouba
- Oluwafemi Odeyale
- 朱莉安娜Seredova
- 拉斐尔Lebovits
- 克里斯汀Beshara
- 蒲云盘
- 黛布拉自己
- Adewale Omotara
- 索尼娅Aracena
- Aiying张
- Bopha太阳
- Dhimiter Llambiri
- Manisha帕特尔
- 马修Mohebban
- 威尔逊Morocho
- 斯蒂芬妮Donoso
- 杰森·福特
- Akintunde Akinsefunmi