谢磊

附加的导航
关闭

谢磊博士目前是亨特学院计算机科学副教授,纽约城市大学计算机科学、生物学和生物化学博士。他的研究重点是开发新的数据挖掘,生物物理学和系统生物学方法,用于多尺度建模因果基因型-表型关联和药物作用,并应用于复杂疾病的药物发现。2004年至2011年,他是圣地亚哥超级计算机中心(SDSC)的首席科学家。在加入SDSC之前,他曾在罗氏制药公司和爱德根制药公司工作,开发药物发现的企业平台。他曾在哥伦比亚大学巴里·霍尼格教授的团队和霍华德·休斯医学研究所接受过计算生物学的博士后培训。他在Rutgers University获得有机化学博士学位和计算机科学硕士学位,在中国科学技术大学获得聚合物物理学学士学位。

联系信息

谢磊博士

副教授

亨特学院
电话:619.347.7483
谢磊,博士

院系:计算机科学

学科:

  • 数据科学
  • 生物物理学
  • 系统生物学

研究题目

生物数据挖掘,结构系统药理学,精准医学

我的主要研究兴趣是开发和应用新的计算技术来理解复杂疾病的遗传、分子和细胞机制,如癌症、阿尔茨海默病和耐药细菌感染,以及药物在治疗中的作用。最终目标是合理设计安全有效的精准药物。我的研究方法包括开发新的数据挖掘算法,以及将大数据分析与基于机制的建模和仿真(例如生物物理学和系统生物学)相结合。

倪志辉,A. C. Yuksel,倪晓燕,M. I. Mandel,谢磊(2017)“困惑还是不困惑?”利用双向LSTM递归神经网络从EEG数据中分离脑活动。ACM-BCB 17。波士顿,马萨诸塞州,美国

王爱安,林海华,林世英。谢磊(2017)天线,一个多级,多层推荐系统,用于推断可靠的药物-基因-疾病关联:重新利用二氮氧化物作为靶向抗癌治疗。BioKDD 17。加拿大哈利法克斯

季军,何迪,冯勇,何勇,薛峰,谢磊(2017)JDINAC:使用高维稀疏组学数据的基于联合密度的非参数差分交互网络分析和分类。生物信息学。2017年6月5日doi: 10.1093 /生物信息学/ btx360。[印前Epub]

H.-S。林A. Poleksic,姚艳,佟红红,庄磊,P.孟,谢磊(2016)“使用精确高效的一类协同过滤算法进行大规模脱靶预测及其在药物再利用中的应用”。生物化学学报,12(10):51005135

吴超,张勇,伯恩P. E.,谢磊(2014)“利用综合化学基因组学和结构系统生物学方法的抗感染药物再利用”,太平洋生物计算研讨会,19:136-47

利用结构系统药理学发现抗感染药物:本申请提出应用一种新的结构系统药理学方法来发现对抗耐药细菌的新疗法。角色:首席研究员

结合化学基因组学和结构系统生物学的药物发现:本建议的目标是开发新的计算方法来预测高分辨率蛋白质组尺度的药物-靶标相互作用,并将其应用于抗感染药物的再利用。角色:首席研究员

徐佳,亨特学院计算机科学专业

分子建模大规模计算算法开发